Может, меня в детстве учили неправильно, но учили так.
Входящий в помещение должен приветствовать того, кто уже находится в помещении.
На приветствие нужно ответить: не отвечать невежливо.
Но отрывать человека от еды вдвойне невежливо. Поэтому того, кто ест, вот так приветствуют: приятного аппетита. Что означает: я вас приветствую, вижу, что вы едите, пожалуйста, не отвечайте, не отвлекайтесь.
Проще говоря, это не пожелание, а форма приветствия.
Соответственно, если ты ранее уже здоровался, и аппетита желать бессмысленно - это всё равно что второй раз здороваться.