Раньше это означало "уничтожить в присутствии комиссии". Раздолбать кувалдой, раздавить бульдозером, наконец -- облить бензином и сжечь. Предварительно демонтировав и передав на аффинаж детали, содержащие драгметаллы. Сейчас большую часть аппаратуры и оргтехники обычно требуется передать для утилизации специализированной организации из-за экологических норм.
У нас обычно стараются избежать такой "варварской" утилизации с помощью моря. Море -- это такая вещь, которая имеет свойство забирать себе дорогостоящее оборудование. Сколько там лежит на дне наших бокскореров, черпаков, батометров, розетт, ловушечных станций, размыкателей, CTD-зондов и прочего... Поэтому то, что утонуло, списывается обычно без звука, независимо от цены. Достаточно только акта с подписью капитана о том, что утонуло в таком-то месте, поиск и подъем нецелесообразен. Ну и, разумеется, "топят" то, что нужно списать. Порой от таких актов на списание просто болит живот: "во время шторма ноутбук перепадом давления засосало в незадраенный иллюминатор и выбросило за борт".