Я долго держалась

Во-первых, НДС платится задолго до прибыли. Фактически часть выручки, которую предприятие получается с покупателя, изначально ему не принадлежит и просто транзитом идет в налоговую. То есть, даже если предприятие работает в минус, НДС оно все равно обязано заплатить, причём по приоритету еще до оплаты всех прочих расходов.
Во-вторых, говорю с позиции человека, который работает с финансовыми моделями. Никто не ведет управленческую отчетность и не строит бизнес-планы, учитывая НДС. Максимум, где НДС будет фигурировать - в оборотном капитале как дебиторская/кредиторская задолженность, то есть часть, которая ожидает возмещения/оплаты в бюджет. И ценообразование компании строят без учета НДС, и себестоимость закупок рассчитывают тоже без его учета, и всякие финансовые коэффициенты типа маржинальности рассчитываются на цифрах, очищенных от НДС. Просто потому что по факту для предприятий НДС ни на какие показатели деятельности не влияет, эти деньги вообще не рассматриваются как выручка.
Когда одно предприятие поставляет что-то другому предприятию, оно знает, сколько оно хочет получить за свой товар без учета НДС. Предприятие выставляет эту цену плюс НДС и уплачивает в бюджет кусочек НДС со своей добавленной стоимости, вычитывая сумму входящего НДС, который уже заплатили на предыдущих этапах производственного процесса. И этот кусочек не рассматривается как часть прибыли этого предприятия, ни по факту даже часть выручки. Это просто способ для государства получать налог с конечного потребителя до того, как он этот товар купит.
И так по цепочке товар обрастает добавленной стоимостью и доходит до конечного потребителя - физлица. Физлицо не является плательщиком НДС, поэтому не может предъявить входящий НДС к вычету. То есть, следите за руками. Предприятия, которые произвели товар, являются плательщиками НДС. Поэтому они оплатили в казну каждый только свой кусочек, возместив НДС с предыдущих этапов цепочки. А конечный потребитель, который не является плательщиком, платит продавцу сразу всю сумму налога и тем самым возмещает его сумму всем плательщикам.
Не надо путать косвенные налоги с себестоимостью, налогом на прибыль и прочими издержками, которые несет предприятие. Потому что НДС не является затратами компании, это просто сумма налога с конечного потребителя, которая хитро взимается по кусочкам еще до завершения конечного цикла производства.
Надеюсь, кому-то будет полезно мое путаное объяснение.
Косвенные налоги - вообще вещь не из простых. Хорошо бы в школьную программу включили такие вещи, чтобы потом люди не думали, что НДС - это налог с предприятий, и что в РФ низкая налоговая нагрузка.
Полно таких, кто уверен, что у нас налогов - 13% НДФЛ. А вот если посчитать еще соцвзносы 30% с зарплаты, НДС, акцизы, и прочая, и прочая, совсем другая картина выходит.